Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1B8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X1B8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A087X1B8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A087X1B8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A087X1B8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A087X1B8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A087X1B8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A087X1B8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A087X1B8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A087X1B8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A087X1B8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A087X1B8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A087X1B8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A087X1B8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A087X1B8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A087X1B8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A087X1B8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A087X1B8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A087X1B8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A087X1B8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A087X1B8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A087X1B8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A087X1B8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A087X1B8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A087X1B8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A087X1B8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A087X1B8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A087X1B8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A087X1B8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A087X1B8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
A0A087X1B8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A087X1B8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A087X1B8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A087X1B8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A087X1B8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A087X1B8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A087X1B8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A087X1B8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A087X1B8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A087X1B8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A087X1B8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A087X1B8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A087X1B8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A087X1B8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A087X1B8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A087X1B8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A087X1B8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A087X1B8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25■■□□□ 1.59
A0A087X1B8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A087X1B8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A087X1B8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A087X1B8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A087X1B8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A087X1B8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A087X1B8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A087X1B8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A087X1B8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A087X1B8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A087X1B8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A087X1B8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A087X1B8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A087X1B8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A087X1B8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A087X1B8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A087X1B8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A087X1B8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A087X1B8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
A0A087X1B8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
A0A087X1B8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A087X1B8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A087X1B8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A087X1B8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A087X1B8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A087X1B8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A087X1B8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A087X1B8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A087X1B8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A087X1B8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A087X1B8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A087X1B8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A087X1B8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A087X1B8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A087X1B8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A087X1B8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A087X1B8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A087X1B8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A087X1B8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A087X1B8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A087X1B8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A087X1B8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A087X1B8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A087X1B8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A087X1B8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A087X1B8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A087X1B8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A087X1B8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A087X1B8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
A0A087X1B8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
A0A087X1B8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
A0A087X1B8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A087X1B8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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