Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WXM4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WXM4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087WXM4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087WXM4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087WXM4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087WXM4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087WXM4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087WXM4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087WXM4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087WXM4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087WXM4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087WXM4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087WXM4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087WXM4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A087WXM4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A087WXM4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A087WXM4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A087WXM4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A087WXM4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A087WXM4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A087WXM4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A087WXM4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A087WXM4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A087WXM4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A087WXM4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A087WXM4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A087WXM4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A087WXM4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A087WXM4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A087WXM4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A087WXM4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A087WXM4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A087WXM4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A087WXM4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A087WXM4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A087WXM4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A087WXM4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A087WXM4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A087WXM4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A087WXM4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A087WXM4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A087WXM4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A087WXM4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A087WXM4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A087WXM4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A087WXM4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A087WXM4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A087WXM4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A087WXM4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A087WXM4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A087WXM4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A087WXM4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A087WXM4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A087WXM4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A087WXM4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A087WXM4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A087WXM4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A087WXM4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A087WXM4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A087WXM4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A087WXM4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A087WXM4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A087WXM4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A087WXM4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A087WXM4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A087WXM4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A087WXM4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A087WXM4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A087WXM4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms