Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR36

Vmn1r90, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r90A0A087WR36 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r90A0A087WR36 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r90A0A087WR36 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r90A0A087WR36 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r90A0A087WR36 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r90A0A087WR36 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r90A0A087WR36 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r90A0A087WR36 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r90A0A087WR36 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r90A0A087WR36 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r90A0A087WR36 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r90A0A087WR36 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn1r90A0A087WR36 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn1r90A0A087WR36 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r90A0A087WR36 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r90A0A087WR36 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r90A0A087WR36 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r90A0A087WR36 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r90A0A087WR36 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r90A0A087WR36 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r90A0A087WR36 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r90A0A087WR36 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r90A0A087WR36 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r90A0A087WR36 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r90A0A087WR36 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r90A0A087WR36 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r90A0A087WR36 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r90A0A087WR36 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r90A0A087WR36 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r90A0A087WR36 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r90A0A087WR36 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r90A0A087WR36 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vmn1r90A0A087WR36 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r90A0A087WR36 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r90A0A087WR36 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r90A0A087WR36 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r90A0A087WR36 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r90A0A087WR36 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r90A0A087WR36 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r90A0A087WR36 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r90A0A087WR36 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r90A0A087WR36 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r90A0A087WR36 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r90A0A087WR36 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r90A0A087WR36 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r90A0A087WR36 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r90A0A087WR36 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r90A0A087WR36 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r90A0A087WR36 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r90A0A087WR36 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r90A0A087WR36 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r90A0A087WR36 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r90A0A087WR36 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r90A0A087WR36 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r90A0A087WR36 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r90A0A087WR36 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r90A0A087WR36 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r90A0A087WR36 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r90A0A087WR36 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r90A0A087WR36 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r90A0A087WR36 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r90A0A087WR36 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r90A0A087WR36 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r90A0A087WR36 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r90A0A087WR36 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r90A0A087WR36 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r90A0A087WR36 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r90A0A087WR36 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r90A0A087WR36 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r90A0A087WR36 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn1r90A0A087WR36 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r90A0A087WR36 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r90A0A087WR36 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r90A0A087WR36 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r90A0A087WR36 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r90A0A087WR36 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r90A0A087WR36 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r90A0A087WR36 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r90A0A087WR36 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r90A0A087WR36 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r90A0A087WR36 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r90A0A087WR36 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r90A0A087WR36 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r90A0A087WR36 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r90A0A087WR36 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r90A0A087WR36 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r90A0A087WR36 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r90A0A087WR36 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r90A0A087WR36 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r90A0A087WR36 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r90A0A087WR36 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r90A0A087WR36 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r90A0A087WR36 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r90A0A087WR36 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r90A0A087WR36 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r90A0A087WR36 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r90A0A087WR36 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r90A0A087WR36 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r90A0A087WR36 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn1r90A0A087WR36 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
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