Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6S5

IGKV1-27, Immunoglobulin kappa variable 1-27, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-27A0A075B6S5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IGKV1-27A0A075B6S5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGKV1-27A0A075B6S5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGKV1-27A0A075B6S5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGKV1-27A0A075B6S5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGKV1-27A0A075B6S5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGKV1-27A0A075B6S5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGKV1-27A0A075B6S5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGKV1-27A0A075B6S5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGKV1-27A0A075B6S5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGKV1-27A0A075B6S5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGKV1-27A0A075B6S5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGKV1-27A0A075B6S5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGKV1-27A0A075B6S5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGKV1-27A0A075B6S5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGKV1-27A0A075B6S5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGKV1-27A0A075B6S5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGKV1-27A0A075B6S5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGKV1-27A0A075B6S5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGKV1-27A0A075B6S5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGKV1-27A0A075B6S5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGKV1-27A0A075B6S5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGKV1-27A0A075B6S5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGKV1-27A0A075B6S5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGKV1-27A0A075B6S5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGKV1-27A0A075B6S5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGKV1-27A0A075B6S5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGKV1-27A0A075B6S5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGKV1-27A0A075B6S5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGKV1-27A0A075B6S5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGKV1-27A0A075B6S5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGKV1-27A0A075B6S5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGKV1-27A0A075B6S5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IGKV1-27A0A075B6S5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms