Protein–RNA interactions for Protein: Q9R000

Itgb1bp2, Integrin beta-1-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1bp2Q9R000 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itgb1bp2Q9R000 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itgb1bp2Q9R000 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms