Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc30Q8BVF4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc30Q8BVF4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms