Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 241.7 ms