Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna3O08545 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna3O08545 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna3O08545 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna3O08545 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna3O08545 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna3O08545 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna3O08545 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna3O08545 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efna3O08545 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms