Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ssxb10Q6XAR7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms