Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Knl1Q66JQ7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Knl1Q66JQ7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms