Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfdn6Q03958 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms