Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna3O08545 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efna3O08545 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms