Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MitfQ08874 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MitfQ08874 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MitfQ08874 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MitfQ08874 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms