Protein–RNA interactions for Protein: P80318

Cct3, T-complex protein 1 subunit gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct3P80318 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct3P80318 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct3P80318 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct3P80318 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct3P80318 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct3P80318 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cct3P80318 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cct3P80318 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cct3P80318 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cct3P80318 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cct3P80318 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cct3P80318 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cct3P80318 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cct3P80318 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cct3P80318 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cct3P80318 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cct3P80318 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cct3P80318 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cct3P80318 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cct3P80318 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cct3P80318 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cct3P80318 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms