Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prf1P10820 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prf1P10820 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prf1P10820 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prf1P10820 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prf1P10820 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prf1P10820 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prf1P10820 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prf1P10820 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms