Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Col9a3A2ACT7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a3A2ACT7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.9 ms