Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zcchc8Q9CYA6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zcchc8Q9CYA6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zcchc8Q9CYA6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zcchc8Q9CYA6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zcchc8Q9CYA6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zcchc8Q9CYA6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zcchc8Q9CYA6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zcchc8Q9CYA6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zcchc8Q9CYA6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Zcchc8Q9CYA6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zcchc8Q9CYA6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zcchc8Q9CYA6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zcchc8Q9CYA6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zcchc8Q9CYA6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc8Q9CYA6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.4 ms