Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Knl1Q66JQ7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms