Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Prf1P10820 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prf1P10820 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prf1P10820 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prf1P10820 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prf1P10820 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prf1P10820 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prf1P10820 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms