Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col9a3A2ACT7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.1 ms