Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms