Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Knl1Q66JQ7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Knl1Q66JQ7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms