Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms