Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psme1P97371 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Psme1P97371 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psme1P97371 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psme1P97371 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psme1P97371 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Psme1P97371 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psme1P97371 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms