Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Knl1Q66JQ7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Knl1Q66JQ7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms