Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hmgn5Q9JL35 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmgn5Q9JL35 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmgn5Q9JL35 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmgn5Q9JL35 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmgn5Q9JL35 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmgn5Q9JL35 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmgn5Q9JL35 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmgn5Q9JL35 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmgn5Q9JL35 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmgn5Q9JL35 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmgn5Q9JL35 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmgn5Q9JL35 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmgn5Q9JL35 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmgn5Q9JL35 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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