Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl27Q99N92 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms