Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.5 ms