Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms