Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms