Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kif3aP28741 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif3aP28741 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms