Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhoP15409 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhoP15409 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhoP15409 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhoP15409 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhoP15409 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhoP15409 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhoP15409 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhoP15409 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhoP15409 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhoP15409 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhoP15409 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhoP15409 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhoP15409 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhoP15409 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhoP15409 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhoP15409 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhoP15409 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhoP15409 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhoP15409 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhoP15409 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhoP15409 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhoP15409 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhoP15409 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhoP15409 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhoP15409 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhoP15409 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhoP15409 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhoP15409 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhoP15409 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhoP15409 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhoP15409 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhoP15409 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RhoP15409 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhoP15409 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhoP15409 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhoP15409 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhoP15409 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhoP15409 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhoP15409 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhoP15409 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhoP15409 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhoP15409 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhoP15409 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhoP15409 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhoP15409 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhoP15409 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhoP15409 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhoP15409 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhoP15409 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhoP15409 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhoP15409 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhoP15409 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhoP15409 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhoP15409 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhoP15409 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhoP15409 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhoP15409 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhoP15409 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RhoP15409 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhoP15409 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhoP15409 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhoP15409 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhoP15409 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhoP15409 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhoP15409 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhoP15409 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RhoP15409 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhoP15409 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhoP15409 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RhoP15409 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhoP15409 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhoP15409 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhoP15409 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhoP15409 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhoP15409 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhoP15409 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhoP15409 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RhoP15409 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhoP15409 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhoP15409 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhoP15409 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhoP15409 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhoP15409 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhoP15409 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhoP15409 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhoP15409 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhoP15409 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RhoP15409 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RhoP15409 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RhoP15409 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RhoP15409 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RhoP15409 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RhoP15409 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RhoP15409 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RhoP15409 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RhoP15409 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RhoP15409 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RhoP15409 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RhoP15409 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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