Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb3P09026 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb3P09026 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms