Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna3O08545 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efna3O08545 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna3O08545 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna3O08545 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna3O08545 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna3O08545 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna3O08545 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efna3O08545 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms