Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700019A02RikA0A087WPV9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700019A02RikA0A087WPV9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms