Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
V9GYQ6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
V9GYQ6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
V9GYQ6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
V9GYQ6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
V9GYQ6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
V9GYQ6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
V9GYQ6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
V9GYQ6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
V9GYQ6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
V9GYQ6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
V9GYQ6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
V9GYQ6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
V9GYQ6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
V9GYQ6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
V9GYQ6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
V9GYQ6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
V9GYQ6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
V9GYQ6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
V9GYQ6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
V9GYQ6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
V9GYQ6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
V9GYQ6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
V9GYQ6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
V9GYQ6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
V9GYQ6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
V9GYQ6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
V9GYQ6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
V9GYQ6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
V9GYQ6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
V9GYQ6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
V9GYQ6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
V9GYQ6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
V9GYQ6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
V9GYQ6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
V9GYQ6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
V9GYQ6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
V9GYQ6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
V9GYQ6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
V9GYQ6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
V9GYQ6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
V9GYQ6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
V9GYQ6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
V9GYQ6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
V9GYQ6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
V9GYQ6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
V9GYQ6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
V9GYQ6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
V9GYQ6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
V9GYQ6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
V9GYQ6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
V9GYQ6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
V9GYQ6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
V9GYQ6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
V9GYQ6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
V9GYQ6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
V9GYQ6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
V9GYQ6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
V9GYQ6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
V9GYQ6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
V9GYQ6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
V9GYQ6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
V9GYQ6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
V9GYQ6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
V9GYQ6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
V9GYQ6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
V9GYQ6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
V9GYQ6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
V9GYQ6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
V9GYQ6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
V9GYQ6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
V9GYQ6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
V9GYQ6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
V9GYQ6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
V9GYQ6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
V9GYQ6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
V9GYQ6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
V9GYQ6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
V9GYQ6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
V9GYQ6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
V9GYQ6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
V9GYQ6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
V9GYQ6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
V9GYQ6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
V9GYQ6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
V9GYQ6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
V9GYQ6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
V9GYQ6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
V9GYQ6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
V9GYQ6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
V9GYQ6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
V9GYQ6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
V9GYQ6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
V9GYQ6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
V9GYQ6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
V9GYQ6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
V9GYQ6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
V9GYQ6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
V9GYQ6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
V9GYQ6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms