Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm28036V9GXJ1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm28036V9GXJ1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm28036V9GXJ1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm28036V9GXJ1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm28036V9GXJ1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm28036V9GXJ1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm28036V9GXJ1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm28036V9GXJ1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm28036V9GXJ1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm28036V9GXJ1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm28036V9GXJ1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm28036V9GXJ1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm28036V9GXJ1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm28036V9GXJ1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm28036V9GXJ1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm28036V9GXJ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm28036V9GXJ1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm28036V9GXJ1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm28036V9GXJ1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm28036V9GXJ1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm28036V9GXJ1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm28036V9GXJ1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm28036V9GXJ1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm28036V9GXJ1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm28036V9GXJ1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm28036V9GXJ1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm28036V9GXJ1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm28036V9GXJ1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm28036V9GXJ1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm28036V9GXJ1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm28036V9GXJ1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm28036V9GXJ1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm28036V9GXJ1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm28036V9GXJ1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm28036V9GXJ1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm28036V9GXJ1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm28036V9GXJ1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm28036V9GXJ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm28036V9GXJ1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm28036V9GXJ1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm28036V9GXJ1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm28036V9GXJ1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm28036V9GXJ1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm28036V9GXJ1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm28036V9GXJ1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gm28036V9GXJ1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm28036V9GXJ1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm28036V9GXJ1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm28036V9GXJ1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm28036V9GXJ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm28036V9GXJ1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm28036V9GXJ1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm28036V9GXJ1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm28036V9GXJ1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm28036V9GXJ1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm28036V9GXJ1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm28036V9GXJ1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm28036V9GXJ1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm28036V9GXJ1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm28036V9GXJ1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm28036V9GXJ1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm28036V9GXJ1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm28036V9GXJ1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm28036V9GXJ1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm28036V9GXJ1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm28036V9GXJ1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm28036V9GXJ1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm28036V9GXJ1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm28036V9GXJ1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm28036V9GXJ1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm28036V9GXJ1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm28036V9GXJ1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm28036V9GXJ1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm28036V9GXJ1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm28036V9GXJ1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm28036V9GXJ1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm28036V9GXJ1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm28036V9GXJ1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm28036V9GXJ1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm28036V9GXJ1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm28036V9GXJ1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm28036V9GXJ1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm28036V9GXJ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm28036V9GXJ1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm28036V9GXJ1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm28036V9GXJ1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm28036V9GXJ1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm28036V9GXJ1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm28036V9GXJ1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm28036V9GXJ1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm28036V9GXJ1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm28036V9GXJ1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm28036V9GXJ1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm28036V9GXJ1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm28036V9GXJ1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm28036V9GXJ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gm28036V9GXJ1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gm28036V9GXJ1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm28036V9GXJ1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms