Protein–RNA interactions for Protein: U3KQK5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQK5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
U3KQK5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
U3KQK5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
U3KQK5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
U3KQK5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
U3KQK5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
U3KQK5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
U3KQK5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
U3KQK5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
U3KQK5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
U3KQK5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
U3KQK5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
U3KQK5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
U3KQK5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
U3KQK5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
U3KQK5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
U3KQK5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
U3KQK5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
U3KQK5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
U3KQK5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
U3KQK5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
U3KQK5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
U3KQK5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
U3KQK5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
U3KQK5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
U3KQK5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
U3KQK5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
U3KQK5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
U3KQK5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
U3KQK5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
U3KQK5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
U3KQK5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
U3KQK5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
U3KQK5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
U3KQK5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
U3KQK5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
U3KQK5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
U3KQK5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
U3KQK5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
U3KQK5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
U3KQK5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
U3KQK5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
U3KQK5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
U3KQK5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
U3KQK5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
U3KQK5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
U3KQK5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
U3KQK5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
U3KQK5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
U3KQK5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
U3KQK5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
U3KQK5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
U3KQK5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
U3KQK5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
U3KQK5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
U3KQK5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
U3KQK5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
U3KQK5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
U3KQK5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
U3KQK5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
U3KQK5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
U3KQK5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
U3KQK5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
U3KQK5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
U3KQK5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
U3KQK5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
U3KQK5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
U3KQK5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
U3KQK5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
U3KQK5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
U3KQK5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
U3KQK5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
U3KQK5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
U3KQK5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
U3KQK5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
U3KQK5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
U3KQK5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
U3KQK5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
U3KQK5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
U3KQK5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
U3KQK5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
U3KQK5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
U3KQK5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
U3KQK5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
U3KQK5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
U3KQK5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
U3KQK5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
U3KQK5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
U3KQK5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
U3KQK5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
U3KQK5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
U3KQK5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
U3KQK5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
U3KQK5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
U3KQK5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
U3KQK5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
U3KQK5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
U3KQK5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
U3KQK5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
U3KQK5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms