Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Knop1Q9Z2Q2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Knop1Q9Z2Q2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Knop1Q9Z2Q2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Knop1Q9Z2Q2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Knop1Q9Z2Q2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Knop1Q9Z2Q2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Knop1Q9Z2Q2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Knop1Q9Z2Q2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Knop1Q9Z2Q2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Knop1Q9Z2Q2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Knop1Q9Z2Q2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Knop1Q9Z2Q2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Knop1Q9Z2Q2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Knop1Q9Z2Q2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Knop1Q9Z2Q2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Knop1Q9Z2Q2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Knop1Q9Z2Q2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Knop1Q9Z2Q2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Knop1Q9Z2Q2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Knop1Q9Z2Q2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Knop1Q9Z2Q2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Knop1Q9Z2Q2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Knop1Q9Z2Q2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Knop1Q9Z2Q2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Knop1Q9Z2Q2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Knop1Q9Z2Q2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Knop1Q9Z2Q2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Knop1Q9Z2Q2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Knop1Q9Z2Q2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Knop1Q9Z2Q2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Knop1Q9Z2Q2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Knop1Q9Z2Q2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Knop1Q9Z2Q2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Knop1Q9Z2Q2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Knop1Q9Z2Q2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Knop1Q9Z2Q2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Knop1Q9Z2Q2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Knop1Q9Z2Q2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Knop1Q9Z2Q2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Knop1Q9Z2Q2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Knop1Q9Z2Q2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Knop1Q9Z2Q2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Knop1Q9Z2Q2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Knop1Q9Z2Q2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Knop1Q9Z2Q2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Knop1Q9Z2Q2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Knop1Q9Z2Q2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Knop1Q9Z2Q2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Knop1Q9Z2Q2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Knop1Q9Z2Q2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Knop1Q9Z2Q2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Knop1Q9Z2Q2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Knop1Q9Z2Q2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Knop1Q9Z2Q2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Knop1Q9Z2Q2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Knop1Q9Z2Q2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Knop1Q9Z2Q2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Knop1Q9Z2Q2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Knop1Q9Z2Q2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Knop1Q9Z2Q2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Knop1Q9Z2Q2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Knop1Q9Z2Q2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Knop1Q9Z2Q2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Knop1Q9Z2Q2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Knop1Q9Z2Q2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Knop1Q9Z2Q2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Knop1Q9Z2Q2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Knop1Q9Z2Q2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Knop1Q9Z2Q2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Knop1Q9Z2Q2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Knop1Q9Z2Q2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Knop1Q9Z2Q2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Knop1Q9Z2Q2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Knop1Q9Z2Q2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Knop1Q9Z2Q2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Knop1Q9Z2Q2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Knop1Q9Z2Q2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Knop1Q9Z2Q2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Knop1Q9Z2Q2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Knop1Q9Z2Q2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Knop1Q9Z2Q2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Knop1Q9Z2Q2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Knop1Q9Z2Q2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Knop1Q9Z2Q2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Knop1Q9Z2Q2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Knop1Q9Z2Q2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Knop1Q9Z2Q2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Knop1Q9Z2Q2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Knop1Q9Z2Q2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Knop1Q9Z2Q2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Knop1Q9Z2Q2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Knop1Q9Z2Q2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Knop1Q9Z2Q2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms