Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vamp5Q9Z2P8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp5Q9Z2P8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp5Q9Z2P8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp5Q9Z2P8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp5Q9Z2P8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp5Q9Z2P8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vamp5Q9Z2P8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vamp5Q9Z2P8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vamp5Q9Z2P8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Vamp5Q9Z2P8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Vamp5Q9Z2P8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vamp5Q9Z2P8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vamp5Q9Z2P8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vamp5Q9Z2P8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vamp5Q9Z2P8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vamp5Q9Z2P8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Vamp5Q9Z2P8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vamp5Q9Z2P8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vamp5Q9Z2P8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vamp5Q9Z2P8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vamp5Q9Z2P8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vamp5Q9Z2P8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vamp5Q9Z2P8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vamp5Q9Z2P8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp5Q9Z2P8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp5Q9Z2P8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp5Q9Z2P8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp5Q9Z2P8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp5Q9Z2P8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp5Q9Z2P8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp5Q9Z2P8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp5Q9Z2P8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp5Q9Z2P8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp5Q9Z2P8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp5Q9Z2P8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp5Q9Z2P8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp5Q9Z2P8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp5Q9Z2P8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp5Q9Z2P8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vamp5Q9Z2P8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vamp5Q9Z2P8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vamp5Q9Z2P8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp5Q9Z2P8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vamp5Q9Z2P8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vamp5Q9Z2P8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vamp5Q9Z2P8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vamp5Q9Z2P8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp5Q9Z2P8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp5Q9Z2P8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp5Q9Z2P8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp5Q9Z2P8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp5Q9Z2P8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp5Q9Z2P8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp5Q9Z2P8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp5Q9Z2P8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp5Q9Z2P8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp5Q9Z2P8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp5Q9Z2P8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp5Q9Z2P8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp5Q9Z2P8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp5Q9Z2P8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp5Q9Z2P8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp5Q9Z2P8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms