Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z204

Hnrnpc, Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpcQ9Z204 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HnrnpcQ9Z204 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HnrnpcQ9Z204 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HnrnpcQ9Z204 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HnrnpcQ9Z204 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HnrnpcQ9Z204 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HnrnpcQ9Z204 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HnrnpcQ9Z204 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HnrnpcQ9Z204 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HnrnpcQ9Z204 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HnrnpcQ9Z204 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HnrnpcQ9Z204 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HnrnpcQ9Z204 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HnrnpcQ9Z204 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HnrnpcQ9Z204 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HnrnpcQ9Z204 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HnrnpcQ9Z204 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HnrnpcQ9Z204 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HnrnpcQ9Z204 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HnrnpcQ9Z204 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HnrnpcQ9Z204 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HnrnpcQ9Z204 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HnrnpcQ9Z204 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HnrnpcQ9Z204 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HnrnpcQ9Z204 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HnrnpcQ9Z204 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HnrnpcQ9Z204 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HnrnpcQ9Z204 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HnrnpcQ9Z204 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HnrnpcQ9Z204 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HnrnpcQ9Z204 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HnrnpcQ9Z204 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HnrnpcQ9Z204 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HnrnpcQ9Z204 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HnrnpcQ9Z204 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HnrnpcQ9Z204 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HnrnpcQ9Z204 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HnrnpcQ9Z204 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HnrnpcQ9Z204 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HnrnpcQ9Z204 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HnrnpcQ9Z204 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HnrnpcQ9Z204 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HnrnpcQ9Z204 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HnrnpcQ9Z204 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HnrnpcQ9Z204 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HnrnpcQ9Z204 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HnrnpcQ9Z204 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HnrnpcQ9Z204 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HnrnpcQ9Z204 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HnrnpcQ9Z204 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HnrnpcQ9Z204 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HnrnpcQ9Z204 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HnrnpcQ9Z204 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HnrnpcQ9Z204 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HnrnpcQ9Z204 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HnrnpcQ9Z204 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HnrnpcQ9Z204 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HnrnpcQ9Z204 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HnrnpcQ9Z204 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HnrnpcQ9Z204 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HnrnpcQ9Z204 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HnrnpcQ9Z204 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HnrnpcQ9Z204 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HnrnpcQ9Z204 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HnrnpcQ9Z204 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HnrnpcQ9Z204 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HnrnpcQ9Z204 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HnrnpcQ9Z204 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HnrnpcQ9Z204 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HnrnpcQ9Z204 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HnrnpcQ9Z204 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HnrnpcQ9Z204 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HnrnpcQ9Z204 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms