Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ilf3Q9Z1X4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ilf3Q9Z1X4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ilf3Q9Z1X4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ilf3Q9Z1X4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ilf3Q9Z1X4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ilf3Q9Z1X4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ilf3Q9Z1X4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ilf3Q9Z1X4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ilf3Q9Z1X4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ilf3Q9Z1X4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ilf3Q9Z1X4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ilf3Q9Z1X4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ilf3Q9Z1X4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ilf3Q9Z1X4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ilf3Q9Z1X4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ilf3Q9Z1X4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ilf3Q9Z1X4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ilf3Q9Z1X4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ilf3Q9Z1X4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ilf3Q9Z1X4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ilf3Q9Z1X4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ilf3Q9Z1X4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ilf3Q9Z1X4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ilf3Q9Z1X4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ilf3Q9Z1X4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ilf3Q9Z1X4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ilf3Q9Z1X4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ilf3Q9Z1X4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ilf3Q9Z1X4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ilf3Q9Z1X4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ilf3Q9Z1X4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ilf3Q9Z1X4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ilf3Q9Z1X4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ilf3Q9Z1X4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ilf3Q9Z1X4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ilf3Q9Z1X4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ilf3Q9Z1X4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ilf3Q9Z1X4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ilf3Q9Z1X4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ilf3Q9Z1X4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ilf3Q9Z1X4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ilf3Q9Z1X4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ilf3Q9Z1X4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ilf3Q9Z1X4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ilf3Q9Z1X4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ilf3Q9Z1X4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ilf3Q9Z1X4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ilf3Q9Z1X4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ilf3Q9Z1X4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ilf3Q9Z1X4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ilf3Q9Z1X4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ilf3Q9Z1X4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ilf3Q9Z1X4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ilf3Q9Z1X4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ilf3Q9Z1X4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ilf3Q9Z1X4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ilf3Q9Z1X4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ilf3Q9Z1X4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ilf3Q9Z1X4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ilf3Q9Z1X4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ilf3Q9Z1X4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ilf3Q9Z1X4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ilf3Q9Z1X4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ilf3Q9Z1X4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms