Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T6

Pikfyve, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PikfyveQ9Z1T6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PikfyveQ9Z1T6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PikfyveQ9Z1T6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PikfyveQ9Z1T6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PikfyveQ9Z1T6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PikfyveQ9Z1T6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PikfyveQ9Z1T6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PikfyveQ9Z1T6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PikfyveQ9Z1T6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PikfyveQ9Z1T6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PikfyveQ9Z1T6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PikfyveQ9Z1T6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PikfyveQ9Z1T6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PikfyveQ9Z1T6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PikfyveQ9Z1T6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PikfyveQ9Z1T6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PikfyveQ9Z1T6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PikfyveQ9Z1T6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PikfyveQ9Z1T6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PikfyveQ9Z1T6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PikfyveQ9Z1T6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PikfyveQ9Z1T6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PikfyveQ9Z1T6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PikfyveQ9Z1T6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PikfyveQ9Z1T6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PikfyveQ9Z1T6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PikfyveQ9Z1T6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PikfyveQ9Z1T6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PikfyveQ9Z1T6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PikfyveQ9Z1T6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PikfyveQ9Z1T6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PikfyveQ9Z1T6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PikfyveQ9Z1T6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PikfyveQ9Z1T6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PikfyveQ9Z1T6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PikfyveQ9Z1T6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PikfyveQ9Z1T6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PikfyveQ9Z1T6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PikfyveQ9Z1T6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PikfyveQ9Z1T6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PikfyveQ9Z1T6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PikfyveQ9Z1T6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PikfyveQ9Z1T6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PikfyveQ9Z1T6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PikfyveQ9Z1T6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PikfyveQ9Z1T6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PikfyveQ9Z1T6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PikfyveQ9Z1T6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PikfyveQ9Z1T6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PikfyveQ9Z1T6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PikfyveQ9Z1T6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PikfyveQ9Z1T6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PikfyveQ9Z1T6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PikfyveQ9Z1T6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PikfyveQ9Z1T6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PikfyveQ9Z1T6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PikfyveQ9Z1T6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PikfyveQ9Z1T6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PikfyveQ9Z1T6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PikfyveQ9Z1T6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
PikfyveQ9Z1T6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PikfyveQ9Z1T6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PikfyveQ9Z1T6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PikfyveQ9Z1T6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PikfyveQ9Z1T6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PikfyveQ9Z1T6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PikfyveQ9Z1T6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PikfyveQ9Z1T6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PikfyveQ9Z1T6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PikfyveQ9Z1T6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PikfyveQ9Z1T6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PikfyveQ9Z1T6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PikfyveQ9Z1T6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PikfyveQ9Z1T6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PikfyveQ9Z1T6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PikfyveQ9Z1T6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PikfyveQ9Z1T6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PikfyveQ9Z1T6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PikfyveQ9Z1T6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PikfyveQ9Z1T6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PikfyveQ9Z1T6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PikfyveQ9Z1T6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PikfyveQ9Z1T6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PikfyveQ9Z1T6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PikfyveQ9Z1T6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PikfyveQ9Z1T6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PikfyveQ9Z1T6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PikfyveQ9Z1T6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PikfyveQ9Z1T6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PikfyveQ9Z1T6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PikfyveQ9Z1T6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PikfyveQ9Z1T6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PikfyveQ9Z1T6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PikfyveQ9Z1T6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PikfyveQ9Z1T6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PikfyveQ9Z1T6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PikfyveQ9Z1T6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PikfyveQ9Z1T6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PikfyveQ9Z1T6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PikfyveQ9Z1T6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms