Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z183

Padi4, Protein-arginine deiminase type-4, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi4Q9Z183 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Padi4Q9Z183 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Padi4Q9Z183 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Padi4Q9Z183 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Padi4Q9Z183 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Padi4Q9Z183 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Padi4Q9Z183 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Padi4Q9Z183 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Padi4Q9Z183 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Padi4Q9Z183 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Padi4Q9Z183 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Padi4Q9Z183 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Padi4Q9Z183 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Padi4Q9Z183 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Padi4Q9Z183 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Padi4Q9Z183 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Padi4Q9Z183 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Padi4Q9Z183 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Padi4Q9Z183 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Padi4Q9Z183 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Padi4Q9Z183 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Padi4Q9Z183 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Padi4Q9Z183 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Padi4Q9Z183 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Padi4Q9Z183 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Padi4Q9Z183 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Padi4Q9Z183 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Padi4Q9Z183 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Padi4Q9Z183 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Padi4Q9Z183 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Padi4Q9Z183 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Padi4Q9Z183 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Padi4Q9Z183 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Padi4Q9Z183 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Padi4Q9Z183 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Padi4Q9Z183 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Padi4Q9Z183 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Padi4Q9Z183 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Padi4Q9Z183 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Padi4Q9Z183 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Padi4Q9Z183 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Padi4Q9Z183 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Padi4Q9Z183 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Padi4Q9Z183 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Padi4Q9Z183 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Padi4Q9Z183 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Padi4Q9Z183 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Padi4Q9Z183 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Padi4Q9Z183 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Padi4Q9Z183 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Padi4Q9Z183 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Padi4Q9Z183 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Padi4Q9Z183 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Padi4Q9Z183 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Padi4Q9Z183 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Padi4Q9Z183 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Padi4Q9Z183 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Padi4Q9Z183 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Padi4Q9Z183 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Padi4Q9Z183 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Padi4Q9Z183 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Padi4Q9Z183 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Padi4Q9Z183 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Padi4Q9Z183 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Padi4Q9Z183 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Padi4Q9Z183 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Padi4Q9Z183 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Padi4Q9Z183 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Padi4Q9Z183 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Padi4Q9Z183 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Padi4Q9Z183 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Padi4Q9Z183 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Padi4Q9Z183 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Padi4Q9Z183 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Padi4Q9Z183 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Padi4Q9Z183 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Padi4Q9Z183 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Padi4Q9Z183 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Padi4Q9Z183 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Padi4Q9Z183 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Padi4Q9Z183 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Padi4Q9Z183 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Padi4Q9Z183 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Padi4Q9Z183 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Padi4Q9Z183 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Padi4Q9Z183 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Padi4Q9Z183 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Padi4Q9Z183 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Padi4Q9Z183 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Padi4Q9Z183 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Padi4Q9Z183 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Padi4Q9Z183 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Padi4Q9Z183 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Padi4Q9Z183 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Padi4Q9Z183 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Padi4Q9Z183 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Padi4Q9Z183 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Padi4Q9Z183 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Padi4Q9Z183 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Padi4Q9Z183 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms