Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sumo3Q9Z172 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sumo3Q9Z172 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sumo3Q9Z172 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sumo3Q9Z172 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sumo3Q9Z172 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sumo3Q9Z172 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sumo3Q9Z172 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sumo3Q9Z172 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sumo3Q9Z172 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sumo3Q9Z172 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sumo3Q9Z172 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sumo3Q9Z172 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sumo3Q9Z172 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sumo3Q9Z172 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sumo3Q9Z172 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sumo3Q9Z172 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sumo3Q9Z172 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sumo3Q9Z172 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sumo3Q9Z172 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sumo3Q9Z172 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sumo3Q9Z172 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sumo3Q9Z172 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sumo3Q9Z172 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sumo3Q9Z172 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sumo3Q9Z172 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sumo3Q9Z172 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sumo3Q9Z172 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sumo3Q9Z172 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sumo3Q9Z172 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sumo3Q9Z172 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sumo3Q9Z172 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sumo3Q9Z172 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sumo3Q9Z172 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sumo3Q9Z172 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sumo3Q9Z172 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sumo3Q9Z172 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sumo3Q9Z172 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sumo3Q9Z172 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sumo3Q9Z172 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sumo3Q9Z172 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sumo3Q9Z172 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sumo3Q9Z172 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sumo3Q9Z172 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sumo3Q9Z172 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sumo3Q9Z172 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sumo3Q9Z172 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sumo3Q9Z172 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sumo3Q9Z172 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sumo3Q9Z172 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sumo3Q9Z172 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sumo3Q9Z172 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sumo3Q9Z172 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sumo3Q9Z172 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sumo3Q9Z172 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sumo3Q9Z172 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sumo3Q9Z172 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sumo3Q9Z172 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sumo3Q9Z172 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sumo3Q9Z172 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sumo3Q9Z172 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sumo3Q9Z172 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sumo3Q9Z172 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sumo3Q9Z172 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sumo3Q9Z172 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sumo3Q9Z172 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sumo3Q9Z172 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sumo3Q9Z172 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sumo3Q9Z172 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sumo3Q9Z172 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sumo3Q9Z172 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms