Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dctn3Q9Z0Y1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dctn3Q9Z0Y1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dctn3Q9Z0Y1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dctn3Q9Z0Y1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dctn3Q9Z0Y1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dctn3Q9Z0Y1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dctn3Q9Z0Y1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dctn3Q9Z0Y1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dctn3Q9Z0Y1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dctn3Q9Z0Y1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dctn3Q9Z0Y1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dctn3Q9Z0Y1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dctn3Q9Z0Y1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dctn3Q9Z0Y1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dctn3Q9Z0Y1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Dctn3Q9Z0Y1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Dctn3Q9Z0Y1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dctn3Q9Z0Y1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dctn3Q9Z0Y1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dctn3Q9Z0Y1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dctn3Q9Z0Y1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dctn3Q9Z0Y1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dctn3Q9Z0Y1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dctn3Q9Z0Y1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dctn3Q9Z0Y1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dctn3Q9Z0Y1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dctn3Q9Z0Y1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dctn3Q9Z0Y1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dctn3Q9Z0Y1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dctn3Q9Z0Y1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dctn3Q9Z0Y1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dctn3Q9Z0Y1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dctn3Q9Z0Y1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dctn3Q9Z0Y1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dctn3Q9Z0Y1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dctn3Q9Z0Y1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dctn3Q9Z0Y1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dctn3Q9Z0Y1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dctn3Q9Z0Y1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dctn3Q9Z0Y1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dctn3Q9Z0Y1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dctn3Q9Z0Y1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dctn3Q9Z0Y1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dctn3Q9Z0Y1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dctn3Q9Z0Y1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dctn3Q9Z0Y1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dctn3Q9Z0Y1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dctn3Q9Z0Y1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dctn3Q9Z0Y1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dctn3Q9Z0Y1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dctn3Q9Z0Y1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dctn3Q9Z0Y1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dctn3Q9Z0Y1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dctn3Q9Z0Y1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dctn3Q9Z0Y1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dctn3Q9Z0Y1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dctn3Q9Z0Y1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dctn3Q9Z0Y1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dctn3Q9Z0Y1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dctn3Q9Z0Y1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dctn3Q9Z0Y1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dctn3Q9Z0Y1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dctn3Q9Z0Y1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dctn3Q9Z0Y1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Dctn3Q9Z0Y1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dctn3Q9Z0Y1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dctn3Q9Z0Y1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dctn3Q9Z0Y1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dctn3Q9Z0Y1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dctn3Q9Z0Y1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dctn3Q9Z0Y1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dctn3Q9Z0Y1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Dctn3Q9Z0Y1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dctn3Q9Z0Y1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dctn3Q9Z0Y1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dctn3Q9Z0Y1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dctn3Q9Z0Y1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Dctn3Q9Z0Y1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dctn3Q9Z0Y1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dctn3Q9Z0Y1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dctn3Q9Z0Y1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dctn3Q9Z0Y1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Dctn3Q9Z0Y1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dctn3Q9Z0Y1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Dctn3Q9Z0Y1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dctn3Q9Z0Y1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dctn3Q9Z0Y1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Dctn3Q9Z0Y1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dctn3Q9Z0Y1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dctn3Q9Z0Y1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dctn3Q9Z0Y1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dctn3Q9Z0Y1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dctn3Q9Z0Y1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dctn3Q9Z0Y1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dctn3Q9Z0Y1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dctn3Q9Z0Y1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms