Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gbp2Q9Z0E6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gbp2Q9Z0E6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gbp2Q9Z0E6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gbp2Q9Z0E6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gbp2Q9Z0E6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gbp2Q9Z0E6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gbp2Q9Z0E6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gbp2Q9Z0E6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gbp2Q9Z0E6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gbp2Q9Z0E6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gbp2Q9Z0E6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gbp2Q9Z0E6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gbp2Q9Z0E6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gbp2Q9Z0E6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gbp2Q9Z0E6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gbp2Q9Z0E6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gbp2Q9Z0E6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gbp2Q9Z0E6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gbp2Q9Z0E6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gbp2Q9Z0E6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gbp2Q9Z0E6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gbp2Q9Z0E6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gbp2Q9Z0E6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp2Q9Z0E6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp2Q9Z0E6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gbp2Q9Z0E6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gbp2Q9Z0E6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gbp2Q9Z0E6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gbp2Q9Z0E6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gbp2Q9Z0E6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp2Q9Z0E6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp2Q9Z0E6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gbp2Q9Z0E6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gbp2Q9Z0E6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gbp2Q9Z0E6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gbp2Q9Z0E6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gbp2Q9Z0E6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gbp2Q9Z0E6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gbp2Q9Z0E6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gbp2Q9Z0E6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gbp2Q9Z0E6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp2Q9Z0E6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp2Q9Z0E6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp2Q9Z0E6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp2Q9Z0E6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp2Q9Z0E6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp2Q9Z0E6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp2Q9Z0E6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp2Q9Z0E6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp2Q9Z0E6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp2Q9Z0E6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp2Q9Z0E6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp2Q9Z0E6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp2Q9Z0E6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp2Q9Z0E6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp2Q9Z0E6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gbp2Q9Z0E6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gbp2Q9Z0E6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gbp2Q9Z0E6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gbp2Q9Z0E6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp2Q9Z0E6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp2Q9Z0E6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp2Q9Z0E6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp2Q9Z0E6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp2Q9Z0E6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp2Q9Z0E6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp2Q9Z0E6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp2Q9Z0E6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp2Q9Z0E6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp2Q9Z0E6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp2Q9Z0E6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gbp2Q9Z0E6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Gbp2Q9Z0E6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gbp2Q9Z0E6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gbp2Q9Z0E6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gbp2Q9Z0E6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gbp2Q9Z0E6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gbp2Q9Z0E6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gbp2Q9Z0E6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gbp2Q9Z0E6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gbp2Q9Z0E6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp2Q9Z0E6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp2Q9Z0E6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp2Q9Z0E6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbp2Q9Z0E6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbp2Q9Z0E6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gbp2Q9Z0E6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gbp2Q9Z0E6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbp2Q9Z0E6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbp2Q9Z0E6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbp2Q9Z0E6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbp2Q9Z0E6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp2Q9Z0E6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp2Q9Z0E6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp2Q9Z0E6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp2Q9Z0E6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp2Q9Z0E6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp2Q9Z0E6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gbp2Q9Z0E6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms