Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y625

GPC6, Glypican-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6Q9Y625 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC6Q9Y625 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC6Q9Y625 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC6Q9Y625 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC6Q9Y625 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC6Q9Y625 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC6Q9Y625 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC6Q9Y625 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC6Q9Y625 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC6Q9Y625 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC6Q9Y625 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC6Q9Y625 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC6Q9Y625 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC6Q9Y625 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC6Q9Y625 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC6Q9Y625 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC6Q9Y625 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC6Q9Y625 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPC6Q9Y625 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC6Q9Y625 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC6Q9Y625 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC6Q9Y625 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC6Q9Y625 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC6Q9Y625 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC6Q9Y625 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC6Q9Y625 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC6Q9Y625 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC6Q9Y625 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC6Q9Y625 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC6Q9Y625 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC6Q9Y625 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPC6Q9Y625 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GPC6Q9Y625 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPC6Q9Y625 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPC6Q9Y625 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPC6Q9Y625 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC6Q9Y625 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC6Q9Y625 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC6Q9Y625 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC6Q9Y625 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC6Q9Y625 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC6Q9Y625 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC6Q9Y625 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC6Q9Y625 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC6Q9Y625 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPC6Q9Y625 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPC6Q9Y625 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPC6Q9Y625 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPC6Q9Y625 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPC6Q9Y625 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPC6Q9Y625 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC6Q9Y625 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC6Q9Y625 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC6Q9Y625 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC6Q9Y625 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC6Q9Y625 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC6Q9Y625 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC6Q9Y625 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC6Q9Y625 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC6Q9Y625 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC6Q9Y625 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC6Q9Y625 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC6Q9Y625 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC6Q9Y625 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC6Q9Y625 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC6Q9Y625 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC6Q9Y625 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC6Q9Y625 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC6Q9Y625 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC6Q9Y625 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC6Q9Y625 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC6Q9Y625 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC6Q9Y625 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC6Q9Y625 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GPC6Q9Y625 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GPC6Q9Y625 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GPC6Q9Y625 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC6Q9Y625 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC6Q9Y625 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC6Q9Y625 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC6Q9Y625 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPC6Q9Y625 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPC6Q9Y625 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPC6Q9Y625 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPC6Q9Y625 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPC6Q9Y625 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPC6Q9Y625 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPC6Q9Y625 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC6Q9Y625 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC6Q9Y625 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC6Q9Y625 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC6Q9Y625 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPC6Q9Y625 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPC6Q9Y625 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPC6Q9Y625 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPC6Q9Y625 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPC6Q9Y625 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GPC6Q9Y625 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPC6Q9Y625 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPC6Q9Y625 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms