Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y9

SCN10A, Sodium channel protein type 10 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN10AQ9Y5Y9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCN10AQ9Y5Y9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCN10AQ9Y5Y9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCN10AQ9Y5Y9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCN10AQ9Y5Y9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCN10AQ9Y5Y9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCN10AQ9Y5Y9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCN10AQ9Y5Y9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCN10AQ9Y5Y9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCN10AQ9Y5Y9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCN10AQ9Y5Y9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCN10AQ9Y5Y9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SCN10AQ9Y5Y9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCN10AQ9Y5Y9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCN10AQ9Y5Y9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCN10AQ9Y5Y9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCN10AQ9Y5Y9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCN10AQ9Y5Y9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCN10AQ9Y5Y9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCN10AQ9Y5Y9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCN10AQ9Y5Y9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCN10AQ9Y5Y9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCN10AQ9Y5Y9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCN10AQ9Y5Y9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCN10AQ9Y5Y9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCN10AQ9Y5Y9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCN10AQ9Y5Y9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCN10AQ9Y5Y9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCN10AQ9Y5Y9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN10AQ9Y5Y9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN10AQ9Y5Y9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN10AQ9Y5Y9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN10AQ9Y5Y9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCN10AQ9Y5Y9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCN10AQ9Y5Y9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCN10AQ9Y5Y9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCN10AQ9Y5Y9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCN10AQ9Y5Y9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN10AQ9Y5Y9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN10AQ9Y5Y9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN10AQ9Y5Y9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SCN10AQ9Y5Y9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
SCN10AQ9Y5Y9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN10AQ9Y5Y9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN10AQ9Y5Y9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN10AQ9Y5Y9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN10AQ9Y5Y9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN10AQ9Y5Y9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCN10AQ9Y5Y9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCN10AQ9Y5Y9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCN10AQ9Y5Y9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCN10AQ9Y5Y9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCN10AQ9Y5Y9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCN10AQ9Y5Y9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCN10AQ9Y5Y9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCN10AQ9Y5Y9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCN10AQ9Y5Y9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCN10AQ9Y5Y9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCN10AQ9Y5Y9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCN10AQ9Y5Y9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCN10AQ9Y5Y9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SCN10AQ9Y5Y9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCN10AQ9Y5Y9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCN10AQ9Y5Y9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCN10AQ9Y5Y9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCN10AQ9Y5Y9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCN10AQ9Y5Y9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCN10AQ9Y5Y9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCN10AQ9Y5Y9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCN10AQ9Y5Y9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCN10AQ9Y5Y9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCN10AQ9Y5Y9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCN10AQ9Y5Y9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SCN10AQ9Y5Y9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCN10AQ9Y5Y9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCN10AQ9Y5Y9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCN10AQ9Y5Y9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCN10AQ9Y5Y9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCN10AQ9Y5Y9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SCN10AQ9Y5Y9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SCN10AQ9Y5Y9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCN10AQ9Y5Y9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCN10AQ9Y5Y9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SCN10AQ9Y5Y9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCN10AQ9Y5Y9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCN10AQ9Y5Y9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCN10AQ9Y5Y9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCN10AQ9Y5Y9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SCN10AQ9Y5Y9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCN10AQ9Y5Y9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCN10AQ9Y5Y9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCN10AQ9Y5Y9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCN10AQ9Y5Y9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCN10AQ9Y5Y9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN10AQ9Y5Y9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN10AQ9Y5Y9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN10AQ9Y5Y9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN10AQ9Y5Y9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCN10AQ9Y5Y9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCN10AQ9Y5Y9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms