Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF18Q9Y5U5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF18Q9Y5U5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF18Q9Y5U5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF18Q9Y5U5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFRSF18Q9Y5U5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF18Q9Y5U5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF18Q9Y5U5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF18Q9Y5U5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF18Q9Y5U5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF18Q9Y5U5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF18Q9Y5U5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF18Q9Y5U5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF18Q9Y5U5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFRSF18Q9Y5U5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFRSF18Q9Y5U5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFRSF18Q9Y5U5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFRSF18Q9Y5U5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFRSF18Q9Y5U5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF18Q9Y5U5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms